В состав факультета входит 17 научно-исследовательских лабораторий, три лаборатории поддержки научно-образовательного процесса и две студенческие лаборатории.
Научно-исследовательские лаборатории:
- математической физики (МФ),
- вычислительной электродинамики (ВЭ),
- моделирования процессов тепломассопереноса (МПТМП),
- обратных задач (ОЗ),
- математических методов обработки изображений (ММОИ),
- математического моделирования в физике (ММФ),
- открытых информационных технологий (ОИТ),
- статистического анализа (СА),
- математических проблем компьютерной безопасности (МПКБ),
- вычислительного практикума и информационных систем (ВПиИС),
- вычислительных комплексов (ВК),
- компьютерной графики и мультимедиа (КГиМ),
- технологий программирования (ТП),
- дискретных управляющих систем и их приложений (ДУСП),
- инструментальных средств в математическом моделировании (ИСММ),
- индустриальной математики (ИМ),
- систем управления облачными вычислениями (СУОВ).
Лаборатории поддержки научно-образовательного процесса:
- программного оборудования (ПО),
- программного обеспечения вычислительного практикума (ПОВП),
- вычислительной техники (ВТ).
Студенческие лаборатории: