На факультете ВМК установлены параллельные компьютеры IBM Blue Gene/P и IBM eServer pSeries 690 Regatta.

Студенты, аспиранты и сотрудники факультета также активно используют вычислительные системы суперкомпьютерного комплекса Московского университета: супервычислители «Ломоносов» и «Чебышёв».

Некоторые кафедры и лаборатории факультета ВМК также имеют собственные высокопроизводительные вычислительные системы.